从2008年2月起，福建省食品药品监督管理局门户网站（http://www.fjfda.gov.cn）实现网上受理，省内医疗器械生产企业可登录该网站随时查询申请事项的受理及审批工作进展情况。

2007年，福建省食品药品监督管理局建立了特殊药品监控网络系统，实现了特殊药品产销存的实时在线监控，并与国家食品药品监督管理局、同级卫生及公安等部门实现联网和信息共享。初步建立了行政许可项目网上受理审批系统，部分行政许可项目可实现在线申报、受理、审批与公告等。

目前，福建省食品药品监管系统已初步形成了日常监管的组织领导体系、事前监管体系、事中监控体系和运行管理体系的基本框架。各地在日常监管实践中创造出了许多宝贵的经验。福州市建立了案件办理分区协作、划区监管、与企业建立定点联系、企业药品安全信用分类管理等监管模式。厦门市成功研制了《医疗器械经营企业管理系统》软件，提高了对医疗器械流通的监管水平。漳州市运用CTBS远程接入技术，建立了药品批发企业实时监控系统，实现了对全市药品批发企业实时动态监控。泉州市建立了市县两级监管相对人约谈制度，促进企业守法生产、经营。全省系统干部职工在创新实践中取得的成果、积累的经验，有力地推动了日常监管长效机制的建立与健全，为从根本上保障公众用药安全奠定了良好的基础。