2006年，国务院印发了《关于发展城市社区卫生服务的指导意见》，并召开全国城市社区卫生工作会议动员部署。国务院各有关部门和各级政府积极贯彻落实，大力推进社区卫生服务体系建设，取得积极进展，为建立基本卫生保健制度打下了重要基础。

截止到2006年11月底，全国共有528个城市开展了社区卫生服务，占城市总数的81.0%。其中地级以上城市278个，占地级市以上城市总数的98.2%；市辖区789个，占市辖区总数的92.8%；县级市250个，占县级市总数的67.8%。与2005年相比，开展社区卫生服务工作的地级以上城市增加8个，市辖区增加37个，县级市增加53个。全国社区卫生服务中心和站的总数为23036个，同2005年底（15576个）相比，增加了7460个（47.9%），其中社区卫生服务中心5069个，与2005年底（3460个）相比，增加了1609个（46.5%）。社区卫生服务站17967个，与2005年底（12116个）相比增加了5851个（48.3％）。统计数据表明，全国社区卫生服务网络建设进一步得到加强。

2006年，各地根据《指导意见》和配套文件精神，制定、完善社区卫生服务补助政策，加大政府对社区卫生服务工作的投入力度。据统计，全国24个省、自治区、直辖市明确了地方政府对社区公共卫生服的投入标准（不包括中央财政补助），如：按服务人口年人均最低补助标准，上海市30元，北京市25元，福建省15元，天津市、江苏省、陕西省10元，海南省、新疆维吾尔自治区6元，湖南省、吉林省4元，青海省3元等等。所需经费主要由省、市、区三级政府分别承担。

上海市长宁区、北京市东城区率先推进体制、机制创新，探索建立维护社区卫生服务公益性质的有效运行机制。两地社区卫生服务机构试行收支两条线管理，在确保政府投入的基础上，切断医务人员个人收入与处方、临床检查、医疗收费的直接挂钩关系，同时，改革人事、分配和绩效考核制度，取得良好成效，社区公共卫生服务得到加强，预防保健和上门服务显著增加；医疗服务质量得到改善，有效避免了过度检查、过度用药问题，平均诊疗费用明显下降，减轻了群众的医药费用负担；居民对社区卫生服务机构的满意度和利用率显著上升。目前，浙江省杭州市、四川省成都市、宁夏回族自治区银川市、青海省西宁市、广东省广州市、深圳市等地区正在开展有关试点工作。

各地积极推进社区卫生服务机构内涵建设，探索有效的运行管理机制。北京市城乡统筹，全面推进社区卫生服务体系建设，加强社区卫生服务机构标准化建设和基本设备配置，夯实城市基本卫生保健制度的基础。北京市东城区通过收支两条线改革，居民用药价格比医院降低了19%，单处方平均费用80.2元，与改革前的158.8元相比，降低了49.5%。上海市对社区卫生服务机构实行基本医疗保险经费总额预付，经社区转诊的病人在大医院结算费用时享受一定比例的减免，引导参保职工小病进社区。上海市长宁区实施收支两条线管理，社区卫生服务机构的次均门诊费用下降了24%，居民就诊量增加26％。湖北省武汉市合理规划社区卫生服务网络，改善服务条件，树立品牌形象，吸引大医院高职称离退休医生到社区工作，有效提升了社区卫生服务能力，并对困难群体及社区居民实行减免，得到了居民的广泛认可。

当前，社区卫生服务发展还面临一些问题。一是人才匮乏。二是基础设施薄弱，地区间发展不平衡。三是政府投入不落实，服务功能不健全。四是部分地区领导对发展社区卫生服务认识不够统一。卫生部等部门将进一步统一思想，推进社区卫生服务政策落实。加大对社区卫生服务的投入力度，落实经费保障措施。加强对中西部地区社区卫生服务机构建设。加强社区卫生服务人才队伍建设。进一步完善各项管理制度和技术规范。深入开展社区卫生服务改革试点，保证公益性质。