“两会”期间，中国医药商业协会对医改、产业发展提出建议，并上呈国家发改委、卫生部等相关部门，向政府表达产业界的心声。

中国医药商业协会在组织医药企业进行专题调研工作的基础上，提出《对我国医药卫生体制改革的意见和建议》，认为进行医疗卫生体制改革的重点在于实施医药分业。

分业后，公立医院药品收益的缺口需要政府财政经费补偿机制来保障。

《建议》认为，国家发改委10年来先后降低药品价格20余次，降价品种1100余个，降价总金额达400亿元，但百姓未真正得到实惠。卫生部门组织药品集中招标采购试了6年，各省市招标模式花样翻新，企业费用急剧上升，造成社会资源极大浪费。全国医药商业有17个省汇总性亏损，仅北京6家医药批发企业，两年半的时间就支付中介费4800万元，华北制药、山东新华、山东鲁抗及东北制药等国内知名企业也相继出现亏损。中国药品市场近60％的份额被合资和进口药品占据。

医药商业协会的报告指出，医疗卫生体制改革的重点在于实施医药分业，彻底切断医生、医院与药品销售之间的直接经济联系，打破医院的医生对处方的垄断。对于补偿的经费规模，商业协会根据卫生部门的统计数据做了匡算：2005年全国总诊疗人次为23亿次，入院人次为7184万次，合计药费收入为2988亿元，诊疗费收入为2075亿元，若按30％利润率计算，医院所得药品利润为896亿元，诊疗费利润为623亿元。以此计算，每年国家财政补贴1520亿元即可全额补偿医院。