医疗服务费用一般由政府、社会和个人三方合理承担。但在我国，三方分担的比例不太合理。我国医疗体制改革的结果是，医疗费用逐步由政府负责转变为个人负责，政府投入在全国卫生总费用中所占的比重不断下降。1980年，政府卫生投入占全国卫生总费用的1/3左右，而到2000年这个数字下降到1/7左右。2003年，全国卫生总费用为6598亿元，其中政府投入占17％，企业、社会单位负责占27％，而其余56％则由个人支付。正是个人在医疗费用支出中占的比例太高，政府和社会团体所占比例过低，才是老百姓看病贵的根本原因。

从根本上看，“以药养医”主要还是医疗体制市场化改革与政府责任缺失并存的结果。一方面，药品、医疗器材等都被市场化了，而政府控制下的医疗服务价格却依然低于市场价格，由此造成医疗服务机构的收益迅速下降；另一方面，政府对医院的财政补贴逐年下降，为保持医院的正常运转，政府许可了医院通过药品和检查费用提成进行补贴。这样，医院为了保持收益，就在医疗服务之外设法通过药物和检查等手段来赚取收入，“以药养医”模式随之产生。

因此，单纯的“医药分开”并不能改变医疗服务价格低于市场价格的现实，也无法改变政府对医院财政补贴不足的现实，那么，“医药分开”也就不能彻底解决看病贵的问题。要确保“医药分开”，破解看病贵，政府就必须加大投入，改变目前政府、社会分担医疗服务费用过低，个人分担过重的现象，只有这样，“医药分开”才能真正发挥有效作用。