卫生部中日友好医院是由日本国政府提供无偿援助中日两国政府合作建设的大型综合性现代化医院。1984年10月23日开院，直属中华人民共和国卫生部领导医院位于北京市朝阳区和平里樱花东路，占地9.7公顷，目前建筑面积11万平方米现编制床位1315张，设有53个临床、医技科室附设中日友好临床医学研究所及培训中心。医院以疑难疾病、危急重症诊治为重点以中西医结合为特色，融医疗、教学科研、康复和预防保健等多项功能为一体，同时承担中央干部保健任务以及100多个国家地区的涉外医疗任务。

卫生部中日友好医院于1993年被评为国家三级甲等医院,并先后被评为北京市“十佳”医院和全国“百佳”医院2001年被列为中央保健医院。同时是北京大学临床医学院和北京中医药大学临床医学院。医院现有副高级技术职称以上人员450余人硕士研究生学历以上人员近400人。拥有螺旋扫描CT机、磁共振成像系统血管造影X线机、医用直线加速器等性能先进的大型医疗设备。

建院以来承担了多项国家级、省部级科研课题，曾获国家级省部级科技进步奖等多项奖励。医院的肾内科、神经内科心脏内科、骨科、中医肿瘤科承担国家卫生部临床学科重点项目；中医肿瘤科还是国家中医药管理局重点学科；电化疗科的电化学疗法中医肛肠科的“安氏疗法”是国家卫生部十年百项计划项目；骨科、中医风湿病科、电化疗科检验科承担首都医学发展科研基金重点项目。

建院以来卫生部中日友好医院作为全国医疗行业对外交流的窗口，曾被外国人在京协会评为“外国人在京就医国有医院满意率第一单位”，并与日本美国、法国、韩国等许多国家的大学科研单位和医疗机构建立了良好的合作关系。

卫生部中日友好医院是全国精神文明建设先进单位2003年，被中共中央确定为全国保持共产党员先进性教育活动试点单位之一；同年，在抗击非典斗争中被指定为非典防治专病医院在卫生部党组的直接领导和全院职工的共同努力下，出色地完成了任务。