九芝堂今日公布的2006年年报显示，该年公司净利润获4030.7万元，同比增长71.02%。然而，扣除非经常性损益后的净利润，却基本与上年持平。而资料显示，公司非经常性损益中最大的一块为金额达1386.9万元的投资收益。

九芝堂该年主营业务收入获9.47亿元，同比略降9.88%。每股收益为0.1625。公司在未来经营展望中表示，随着整个医药市场总量的快速增长以及中药逐渐被国际社会所接受，公司发展空间和潜力巨大，然而发改委降价和医院挂网招标的“双降”等情况，也使公司将面临更大的挑战。