由于研发和市场开发的大笔投入导致公司各项费用增长较快，华海药业2006年业绩增收不增利。年报显示，报告期内，公司实现主营业务收入5.57亿元，同比增长31.66%；实现主营业务利润2.65亿元，同比增长15.2%；实现净利润1.1亿元，同比下降14.66%。

报告期内，公司经营有三大亮点。报告期内实现规范市场销售额2680万美元，销售比例达到52.6%，同比增长6.1个百分点，尤其是北美市场的销售比例进一步提高。同时，公司国内制剂业务增长较快，全年实现销售收入5008万元，同比增长46.9%；公司制剂FDA认证项目进展顺利；报告期内，公司位于国家级浙江省化学原料药基地的川南生产厂区逐步进入产能发挥阶段，全年共有五个车间新投入生产。

华海药业2006年度的利润分配预案为每10股派送现金红利2元（含税）。展望2007年，公司计划实现销售收入7亿元，争取实现利润总额1.7亿元。