2008年7月10日，总投资25亿元的方正集团医药制造基地在重庆市北碚区水土镇举行了奠基仪式。该基地坐落在重庆市北碚区水土镇工业集中区，建成后将成为与国际制药企业接轨的现代化、国际化的生物化学药品制造基地。重庆市政府、北碚区政府相关领导和方正集团董事长、CEO等出席了奠基仪式。

据介绍，方正集团医药制造基地分两期投资兴建，在三至五年内将成为西南地区生物精细化工医药产业的龙头企业。该基地一期将于2010年全部建成投产,销售收入预计将达到35亿元，利税5亿元，;二期预计2012年全部建成投产，届时，销售收入将达50亿元，利税7亿元。

重庆市副市长黄奇帆在讲话中指出：“方正集团医药制造基地的投资兴建，必将成为发展循环经济，建设资源节约型、环境友好型社会的典范;成为企业规模扩张，提档升级，做大做强的标杆;成为谱写医药工业发展新篇章的开篇之作。”“重庆市委、市政府将坚定不移地关心和支持方正集团在重庆的发展。”

方正集团董事长魏新对重庆市政府、北碚区政府给予方正集团医药产业建设的大力支持表示衷心感谢，他说：“近年来，方正集团确立了IT、医疗医药双主业的发展战略，主动寻求跨越式发展机遇，将方正做实、做强、做大，力争成为一个国际化的企业集团。此次，集团投资25亿元兴建的医药制造基地，将建设成为与国际制药企业接轨的现代化、国际化的生物化学药品制造基地，同时也将成为方正集团在西南地区的医药产业总部。当今的重庆，是中国西南部最具投资和发展潜力的地区之一，方正集团医药制造基地在重庆落户，必将促进集团医药产业的发展，并对地区经济的发展做出应有的贡献。”

另悉，医疗医药是方正集团的第二主业。近年来，方正集团大力发展医疗医药产业，2007年，方正集团控股的北京北大国际医院集团有限公司投资兴建的北大国际医院在北京中关村生命科学园奠基，总投资约32亿元，建成后将成为北京最大的综合医院。方正集团正致力于通过整合制药企业、设备租赁、物流企业，形成集医院、制药、设备租赁、物流和医疗IT于一体的产业链，成为中国生命健康领域产品与服务的综合提供商。