1999年9月9日，随着"国际人类基因组计划 1% 项目"的正式启动，北京华大基因研究中心也随之孕育而生。自成立之日起，华大基因孜孜不倦的致力于高水平的科学研究工作，不断超越自己，为科教兴国做出自己最大的贡献并取得了举世瞩目的成绩。2001年8月华大基因出色完成了人类基因组计划（中国卷）的任务.

同年10月独立完成水稻基因组"工作框架图"绘制和数据库建设，并向全球公布；成为我国生命科学领域的重大突破，并被国际科学界誉为"里程碑"式的贡献。以上两项成果还被江泽民主席在两院院士大会上列入我国生命科学历程中的重大成就。此后，水稻"完成图"、家蚕、家鸡、家猪、SARS、猪链球菌等一系列关系国计民生的基因组项目的圆满完成使我们赢得了更加广泛的肯定和尊重。

2007年10月11日，在深圳第九届高交会开幕之际，深圳华大基因研究院向世界发布第一个黄种人全基因序列图谱。是首个100%由中国人分析完成的基因组图谱。

华大人并不满足于在基因组测序领域所取得的一系列辉煌成就，而是立足长远，在不断深化科研水平和能力的前提下加快技术向市场转化的步伐，力争在为祖国科技界取得荣誉的同时最大限度地将我们的科研技术能力服务于社会。在科研上我们希望从整体的角度系统地解决生物学的问题，在产业上我们的目标是满足社会日益增长的对生物技术革命带来的各项需求。

在这样思想的指导下，通过多年的建设，华大基因已成为拥有基因组学、生物信息学、蛋白质组学、基因多态功能研究和药物筛选五大技术平台的国内最大的相关综合性研究中心。传统Sanger测序平台由107台MegaBACE 1000和以ABI 3730xl为主的26台ABI测序仪构成，日产数据超过50Mb。Solexa测序平台拥有6套Illumina Genome Analyzer测序仪，目前平均日数据产量达3Gb。由来自计算机、数学、物理、生物、医学等各种背景的研究人员组成的生物信息分析平台拥有9台超级计算机，约800颗CPU，2T内存和400T的存储。截至到2007年4月份，在国际各大基因组研究中心的测序和数据分析排名上，华大基因位居第三；在商业服务领域，已经成为领先的测序服务机构。

在科研服务领域，华大基因依靠完善的技术设备力量，雄厚的科研背景和优秀的人才队伍，致力于为广大生物学相关领域科研工作者和研发机构提供基因与蛋白质相关研究的整体解决方案，并在多年的研发基础上形成了一系列有自己特色的科研产品。我们希望通过与科学家们的密切配合和坚持不懈的努力，为提高我国在相关研究领域的整体水平做出一点贡献