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找茬游戏寻找肿瘤标记
作者:佚名    文章来源:生物通    点击数:    更新时间:2007-6-25
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“癌症”这个词来源于希腊语“karkinos(螃蟹)”,据说是古希腊医生Hippocrates觉得肿瘤引起的凸起的血管看上去和螃蟹腿差不多,因此给肿瘤起名为karkinos。Cancer被古英语引用,变成canker,而后来又一次被以原形引用,用来指癌症。迄今为止,癌症的治愈力还非常非常低。

细胞中的DNA是整个系统的策划者,发布RNA形式的“命令”,RNA再翻译出蛋白。所有细胞虽然基因相似,但依据它们的作用和收到的外界环境的信息,不同细胞在不同时刻只是发布特定命令。正常细胞中,这种过程以有组织的方式进行,但癌细胞中的RNA完全改变。胰腺癌(Pancreatic  cancer,PC)是所有癌症中最难治愈的一种,当胰腺细胞转变为癌细胞时,它们放弃了正常的功能,开始发布加快分裂和入侵邻近组织的异常信息。

此次研究的目的是破译胰腺癌细胞转录的RNA,将这些RNA与正常胰腺细胞转录的RNA进行对比,寻找那些负责肿瘤生长和入侵的RNA及这些RNA翻译的蛋白。研究人员采集胰腺活检组织和健康胰腺样本,利用微列阵(或称DNA芯片)对这些样本的数千个基因转录的RNA进行定性和定量分析。

首先是提取样本的RNA,并进行荧光标记。RNA能够和与之互补的DNA结合。微列阵上排列有序的DNA片段能够检测人类基因组中将近3万个基因所转录的RNA。当RNA接触微列阵后,和与其互补的DNA结合,产生荧光信号。

第二步是对比肿瘤细胞和正常细胞的芯片荧光图像。好像“找茬(Spot  the  difference)”游戏,研究人员寻找两张图像的不同之处。然而此次实验中的两张图的差异并不是游戏中的那么简单,需要对比密集点阵形成的复杂图像。结果,研究人员发现116个RNA在癌细胞中过量表达。

这些RNA可能是促进癌细胞快速生长、扩散和入侵其它组织的命令,它们和它们所编码的蛋白是治疗、诊断癌症的潜在靶标。

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